电子商票的无因追索特性，使其成为天然的利用核心企业商业信用融资的理想工具。并且最近得到了很多政策的支持，我国电子商票市场得到了较快发展。而由于发展时间较短，市场尚不健全，存在着一些问题，下面我们一起来了解一番。
问题一、核心企业利用自身强势地位，大量进行赊销交易，开票动力不足
电子商票作为一种支付结算工具，其明确列示了债权债务关系和还款期限。而传统赊销贸易形成的应收账款则具有很强的灵活性，核心企业往往运用自己的强势地位，无故拖延账期，降低自己的资金需求，将融资成本转嫁给中小企业。因此，核心企业一般会选择赊账而不开具电子商票。
问题二、ECDS系统准入门槛低，企业资质核验不到位
根据《电子商业汇票业务管理办法》规定，企业开通电子商业汇票业务，只需具备组织机构代码，并在银行开立人民币银行结算账户。银行只需审核企业基本信息的真实性，缺乏对企业经营状况、财务状况、资信状况等进行深入了解和审核，不对电子商业承兑汇票的出票人、承兑人进行信用评级。签发企业无需抵押、担保等手续，即可随意出票，门槛很低。
我国缺少统一的商业信用评估体系，银行在办理电子商票贴现业务是对于电子商票承兑人的商业信用评价往往基于内部评级，但是各个银行不对外发布，标准也不统一。第三方评级公司目前还没有开发出普遍被认可的票据评级产品。
问题三、银行贴现门槛高，手续繁琐
电子商票在银行贴现融资存在着许多障碍，中小企业票据贴现难度较大，虽然现在有个别银行推出了种种措施来便利电子商票银行贴现，但是没有根本改变这一局面。
障碍主要表现在两个方面，一是银行往往采用双重授信的机制，即对承兑人和持票人双重授信，但是广大持票的中小企业授信少，甚至没有授信，阻碍了其通过票据贴现融资；二是电子商票全国流转，持票人往往和承兑人分属不同区域，持票人所在区域的银行因异地的原因不了解承兑企业，往往不会跨地区给予授信，所以不愿接受异地票据贴现。
问题四、存在以融资为目的签发电子商票的现象，扭曲票据市场
我国《票据法》第10条规定，票据的签发、取得和转让应当遵循诚实信用原则，具有真实的交易关系和债权债务关系。由此可见，真实交易关系或债权债务关系是债务人签发票据的前提条件。
目前，在电子商票市场上存在个别企业为了融资而随意开具票据的现象，这些票据往往开出后，在关联方之间制造一两次虚假交易就拿到市场上进行融资套现，实现融资的目的。
但这些融资都是没有真实生产经营关系作为基础的，融来的资金大多用来还债或者盲目投资，催生出大量泡沫，容易引发债务违约和市场连锁反应。这种行为扰乱商业信用的建立，不利于商业信用环境的净化和培育。
问题五、金融强监管的背景下，电子商票融资渠道受限
由于银行的风险偏好及授信管理制度，其贴现的主要标的为电子银票，大量的电子商票无法从银行融资。广大中小企业当面临融资需求时，往往将电子商票通过保理公司移至互联网直接融资平台进行融资。
但是随着国家对互联网融资平台的清退，特别是2019年10月银保监会发布《关于加强商业保理企业监督管理的通知》（简称“205号文”），通知中明令禁止商业保理公司“通过网络借贷信息中介机构、地方各类交易场所、资产管理机构以及私募投资基金等机构融入资金”、“因票据或其他有价证券而产生的付款请求权等开展保理融资业务”。这导致电子商票互联网直融的模式受到很大的限制，电子商票目前没有很好的融资渠道。
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